今年起，国家高新申请及认定后监管不断趋于严格，企业、认定机构、评审专家及中介机构都被纳入重点检查的对象。那些通过财务数据造假、技术资料造假、研发活动造假，拼凑起来的的“假高新、“伪高新””企业，将面临各种税务风险。
2020年，国家科技部火炬高技术产业开发中心抽查了享受高新技术企业税收优惠的400余家企业，核销了300余家企业的高新技术资质，占比高达80%以上。高新技术企业核查结果公布后，财政部、科技部和国家税务总局等监管部门认识到了很多企业会铤而走险，所以当下依然在不断加强对高新技术企业的检查力度，一大批存有各种问题的高新企业终将露出真面目。企业违法行为一旦东窗事发，不但要面临补缴巨额税款、加收滞纳金，日后也将无法享受税收优惠，这对企业而言无疑面临着双重打击。
科技部门重点审核的企业方向：
1、"看外观"
没有科技感的公司名称或者没有现代化的生产研发环境，这类企业会面临着吃亏，这部分企业绝大多数是经营年限已久，行业传统，以原加工贸易企业为主，它们的经营范围跟高新技术领域要求符合度很低，往往只是擦边而已，所以一旦抽中现场考察，真正的高科技元素得不到凸显，很容易被"毙"掉。
2、"看支出"
抽查企业的实际研发费支出时，企业财务人员的专业度和是否有建立规范的研发费用科目或研发费用台账显得尤为重要，不然很难解释每一笔研发费用支出的合理性，特别是研发费用比例处在达标线左右的企业，一旦被踢掉若干项目的费用，总额上就会因研发费用不达标而被否定。
3、"看内在"
企业留底备查数据会成为重点审核对象，数据以税局稽查为主，高新技术企业60%主营产品收入证明，按《高新技术企业认定管理办法》规定，高新技术企业产品收入是指企业通过研发和相关技术创新活动，取得产品(服务)收入与技术性收入的总和。
对企业取得上述收入发挥核心支持作用的技术应属于《高新技术企业八大领域》规定的范围，这一条如果严格来说，企业只是代理他人的高科技产品都不能算在内，何况从事的行业技术相对成熟，没有附加的创意研发，这一类高新技术企业产品收入证明很难站住脚，被相中否决的概率也很大。
